《百妖谱》第四季动画故事讲述，桃天带着小和尚磨牙、小狐妖滚滚和桃都老邻居柳公子一起继续为了寻找失踪的百妖谱而云游四方，在途中遇到暗刀、百知、风果、孰湖、枫生、趸鱼六个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症的故事

影片讲述了在一个没有被历史所记载的朝代，因为它很短，而在这短短的十余年中，相传勾陈大帝留在凡间用来镇妖封煞的镇妖石被天火所毁，百妖肆出，从此举国上下都在忙活着研究同一件事儿，如何降妖。影片不仅呈现

桃夭带着小和尚磨牙、第一季收服的小狐妖、桃都老邻居柳公子一起，为了寻找失踪的百妖谱而云游四方。在途中遇到应声、化蛇、媪姬、照海四个妖怪，为妖怪治疗各种疑难杂症。

鬼医桃夭，善恶如谜。金铃过处，片甲不留。讲百种妖怪，述世间沧桑。她是所有妖怪的救星，也是所有妖怪的噩梦。她带着磨牙小和尚行走江湖，也是鬼医桃夭。桃都鬼医桃夭只治妖怪不治人，她带着小和尚磨牙一起云游

未曾出过命案的平安镇忽然屡发奇案，在此之前妖王护法混沌老妖逃出封印，一时间，风起云涌，百妖乱世。胆小怕事的小捕快黄河楼穷困潦倒，不受县太爷的重视，连心仪的女子酒楼老板莲柔也对他若即若离，在他失落之时，意外遭到蛇精诱惑，险些丧命，幸得自己的外公王远知相救并由此得知自己肩负着封印妖王的任务。外公传授给他降妖除魔之法，并将教派至宝九天玄玉和《百妖全书》交给他。拥有九天玄玉之力的黄河楼接二连三降伏了狐妖蝶妖等，几经周折，他逃出了混沌老妖的魔掌。兔妖利用莲柔的身份企图抢夺九天玄玉，此时混沌老妖已得知可以借助黄河楼的